MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 74161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	T	7	7	160	166	0 %	100 %	0 %	0 %	336171144
2	NC_015638	ATT	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
3	NC_015638	AACA	2	8	277	284	75 %	0 %	0 %	25 %	336171144
4	NC_015638	A	6	6	296	301	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
5	NC_015638	CTG	2	6	320	325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171144
6	NC_015638	GATGTC	2	12	337	348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336171144
7	NC_015638	A	6	6	354	359	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
8	NC_015638	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336171144
9	NC_015638	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171144
10	NC_015638	TTA	2	6	538	543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
11	NC_015638	A	6	6	620	625	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
12	NC_015638	TAT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
13	NC_015638	AT	3	6	633	638	50 %	50 %	0 %	0 %	336171144
14	NC_015638	ACA	2	6	657	662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171144
15	NC_015638	AT	3	6	663	668	50 %	50 %	0 %	0 %	336171144
16	NC_015638	AATT	2	8	716	723	50 %	50 %	0 %	0 %	336171144
17	NC_015638	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171144
18	NC_015638	T	6	6	784	789	0 %	100 %	0 %	0 %	336171144
19	NC_015638	TAT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
20	NC_015638	A	6	6	954	959	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
21	NC_015638	AGA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171144
22	NC_015638	TAT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
23	NC_015638	TAA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171144
24	NC_015638	A	6	6	1087	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
25	NC_015638	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
26	NC_015638	AGT	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171144
27	NC_015638	ATT	2	6	1190	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171144
28	NC_015638	T	6	6	1270	1275	0 %	100 %	0 %	0 %	336171144
29	NC_015638	TAGC	2	8	1301	1308	25 %	25 %	25 %	25 %	336171144
30	NC_015638	ATC	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171144
31	NC_015638	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	336171144
32	NC_015638	CTC	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336171145
33	NC_015638	AAATT	2	10	1525	1534	60 %	40 %	0 %	0 %	336171145
34	NC_015638	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171145
35	NC_015638	TAA	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171145
36	NC_015638	CTA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171145
37	NC_015638	TGG	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171145
38	NC_015638	TGA	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171145
39	NC_015638	TGA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171145
40	NC_015638	AAC	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171145
41	NC_015638	T	6	6	1986	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	336171146
42	NC_015638	T	7	7	1993	1999	0 %	100 %	0 %	0 %	336171146
43	NC_015638	ACA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171146
44	NC_015638	ATT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
45	NC_015638	CAGG	2	8	2126	2133	25 %	0 %	50 %	25 %	336171146
46	NC_015638	ATT	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
47	NC_015638	T	6	6	2179	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	336171146
48	NC_015638	TGG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
49	NC_015638	TTA	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
50	NC_015638	TAA	3	9	2287	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
51	NC_015638	AT	3	6	2361	2366	50 %	50 %	0 %	0 %	336171146
52	NC_015638	TGG	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
53	NC_015638	T	6	6	2431	2436	0 %	100 %	0 %	0 %	336171146
54	NC_015638	AAC	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171146
55	NC_015638	CTG	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171146
56	NC_015638	GAA	2	6	2690	2695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171146
57	NC_015638	CA	4	8	2758	2765	50 %	0 %	0 %	50 %	336171146
58	NC_015638	AACA	2	8	2797	2804	75 %	0 %	0 %	25 %	336171146
59	NC_015638	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171146
60	NC_015638	TA	3	6	2880	2885	50 %	50 %	0 %	0 %	336171146
61	NC_015638	T	6	6	2921	2926	0 %	100 %	0 %	0 %	336171146
62	NC_015638	TTC	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171146
63	NC_015638	AGT	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171146
64	NC_015638	ACT	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171146
65	NC_015638	AGG	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336171146
66	NC_015638	AT	3	6	3077	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	336171146
67	NC_015638	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	336171146
68	NC_015638	ATT	3	9	3131	3139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171146
69	NC_015638	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
70	NC_015638	CAAA	2	8	3262	3269	75 %	0 %	0 %	25 %	336171146
71	NC_015638	TATT	2	8	3301	3308	25 %	75 %	0 %	0 %	336171146
72	NC_015638	A	6	6	3347	3352	100 %	0 %	0 %	0 %	336171146
73	NC_015638	TAA	2	6	3357	3362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171146
74	NC_015638	ACA	2	6	3404	3409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171147
75	NC_015638	A	8	8	3451	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
76	NC_015638	TGT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171147
77	NC_015638	TGAAAA	2	12	3487	3498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336171147
78	NC_015638	A	6	6	3495	3500	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
79	NC_015638	AGA	2	6	3506	3511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171147
80	NC_015638	A	8	8	3517	3524	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
81	NC_015638	A	6	6	3536	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
82	NC_015638	ATA	2	6	3708	3713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171147
83	NC_015638	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171147
84	NC_015638	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171147
85	NC_015638	A	6	6	3830	3835	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
86	NC_015638	AATC	2	8	3872	3879	50 %	25 %	0 %	25 %	336171147
87	NC_015638	GTT	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336171147
88	NC_015638	TTGC	2	8	3966	3973	0 %	50 %	25 %	25 %	336171147
89	NC_015638	AT	3	6	3994	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	336171147
90	NC_015638	AATG	2	8	4016	4023	50 %	25 %	25 %	0 %	336171147
91	NC_015638	A	8	8	4025	4032	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
92	NC_015638	TTAT	2	8	4061	4068	25 %	75 %	0 %	0 %	336171147
93	NC_015638	A	6	6	4083	4088	100 %	0 %	0 %	0 %	336171147
94	NC_015638	T	6	6	4113	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	336171148
95	NC_015638	CTT	2	6	4216	4221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171148
96	NC_015638	T	6	6	4227	4232	0 %	100 %	0 %	0 %	336171148
97	NC_015638	TGC	3	9	4257	4265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171148
98	NC_015638	CGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336171148
99	NC_015638	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171148
100	NC_015638	TTA	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
101	NC_015638	A	6	6	4399	4404	100 %	0 %	0 %	0 %	336171148
102	NC_015638	ATT	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
103	NC_015638	CAA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171148
104	NC_015638	CAG	2	6	4643	4648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171148
105	NC_015638	T	6	6	4674	4679	0 %	100 %	0 %	0 %	336171148
106	NC_015638	TTA	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171148
107	NC_015638	TAC	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171148
108	NC_015638	AACT	2	8	4746	4753	50 %	25 %	0 %	25 %	336171148
109	NC_015638	T	8	8	4762	4769	0 %	100 %	0 %	0 %	336171148
110	NC_015638	AGTT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	25 %	0 %	336171149
111	NC_015638	CTGT	2	8	5048	5055	0 %	50 %	25 %	25 %	336171149
112	NC_015638	AATA	2	8	5063	5070	75 %	25 %	0 %	0 %	336171149
113	NC_015638	CAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171149
114	NC_015638	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171149
115	NC_015638	TAC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336171149
116	NC_015638	AAG	2	6	5166	5171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171149
117	NC_015638	GCA	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171149
118	NC_015638	CTG	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171149
119	NC_015638	CCAT	2	8	5406	5413	25 %	25 %	0 %	50 %	336171149
120	NC_015638	A	6	6	5430	5435	100 %	0 %	0 %	0 %	336171149
121	NC_015638	ACC	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171149
122	NC_015638	T	8	8	5469	5476	0 %	100 %	0 %	0 %	336171149
123	NC_015638	TAT	2	6	5572	5577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171149
124	NC_015638	TAA	2	6	5636	5641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336171149
125	NC_015638	ACC	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336171149
126	NC_015638	TGC	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171149
127	NC_015638	ACA	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171149
128	NC_015638	TCT	2	6	5684	5689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336171149
129	NC_015638	A	7	7	5717	5723	100 %	0 %	0 %	0 %	336171149
130	NC_015638	CAGA	2	8	5745	5752	50 %	0 %	25 %	25 %	336171149
131	NC_015638	TTAT	2	8	5813	5820	25 %	75 %	0 %	0 %	336171150
132	NC_015638	TGC	2	6	5852	5857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336171150
133	NC_015638	T	6	6	5891	5896	0 %	100 %	0 %	0 %	336171150
134	NC_015638	CAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336171150
135	NC_015638	AATA	2	8	5910	5917	75 %	25 %	0 %	0 %	336171150
136	NC_015638	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336171150
137	NC_015638	GTTT	2	8	6022	6029	0 %	75 %	25 %	0 %	336171150
138	NC_015638	TA	3	6	6039	6044	50 %	50 %	0 %	0 %	336171150
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386	NC_015638	AT	5	10	18065	18074	50 %	50 %	0 %	0 %	336171164
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389	NC_015638	T	6	6	18237	18242	0 %	100 %	0 %	0 %	336171164
390	NC_015638	ATG	2	6	18263	18268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336171164
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392	NC_015638	ATT	2	6	18313	18318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171164
393	NC_015638	AGC	2	6	18357	18362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336171164
394	NC_015638	AGA	2	6	18366	18371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336171164
395	NC_015638	CGATA	2	10	18448	18457	40 %	20 %	20 %	20 %	336171164
396	NC_015638	A	6	6	18528	18533	100 %	0 %	0 %	0 %	336171164
397	NC_015638	AAAG	2	8	18706	18713	75 %	0 %	25 %	0 %	336171164
398	NC_015638	TTA	2	6	18721	18726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336171164
399	NC_015638	A	6	6	18760	18765	100 %	0 %	0 %	0 %	336171164
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